MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acetobacter pasteurianus 386B plasmid Apa386Bp1

Total Repeats: 3598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021976	TAA	2	6	189011	189016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218752
3502	NC_021976	CTG	2	6	189036	189041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218752
3503	NC_021976	AGGT	2	8	189198	189205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021976	AT	4	8	189230	189237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021976	TGG	2	6	189281	189286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218753
3506	NC_021976	GAA	2	6	189402	189407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218753
3507	NC_021976	G	6	6	189448	189453	0 %	0 %	100 %	0 %	529218753
3508	NC_021976	GTGC	2	8	189506	189513	0 %	25 %	50 %	25 %	529218753
3509	NC_021976	GCGG	2	8	189619	189626	0 %	0 %	75 %	25 %	529218753
3510	NC_021976	GCA	2	6	189758	189763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218753
3511	NC_021976	ATG	2	6	189813	189818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218753
3512	NC_021976	T	6	6	189934	189939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021976	ATGG	2	8	189958	189965	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021976	TGC	2	6	190023	190028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218754
3515	NC_021976	CAT	2	6	190061	190066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218754
3516	NC_021976	GGC	2	6	190355	190360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218755
3517	NC_021976	TCA	2	6	190392	190397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218755
3518	NC_021976	GAC	2	6	190475	190480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218755
3519	NC_021976	CCG	2	6	190644	190649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218755
3520	NC_021976	TGT	2	6	190684	190689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218755
3521	NC_021976	T	6	6	190787	190792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021976	TTA	2	6	190819	190824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021976	AAG	2	6	190847	190852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021976	TA	3	6	190859	190864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021976	TTG	2	6	190882	190887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021976	AT	3	6	190906	190911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021976	TAT	2	6	190915	190920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021976	AGA	2	6	190971	190976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218756
3529	NC_021976	CAT	2	6	191028	191033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218756
3530	NC_021976	CTG	2	6	191056	191061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218756
3531	NC_021976	GCC	2	6	191143	191148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218756
3532	NC_021976	GGC	2	6	191177	191182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218756
3533	NC_021976	TGC	2	6	191192	191197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218756
3534	NC_021976	CAT	2	6	191205	191210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218756
3535	NC_021976	ATT	2	6	191252	191257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218756
3536	NC_021976	GCA	2	6	191290	191295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218756
3537	NC_021976	GCG	2	6	191331	191336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	529218756
3538	NC_021976	CAG	2	6	191353	191358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218756
3539	NC_021976	ATG	2	6	191467	191472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218756
3540	NC_021976	GTG	2	6	191602	191607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218756
3541	NC_021976	ATA	2	6	191627	191632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218756
3542	NC_021976	GGT	2	6	191725	191730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218756
3543	NC_021976	TGG	2	6	191750	191755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218756
3544	NC_021976	GGT	2	6	191802	191807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218756
3545	NC_021976	GCTG	2	8	191913	191920	0 %	25 %	50 %	25 %	529218756
3546	NC_021976	AAG	2	6	191930	191935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218756
3547	NC_021976	TGT	2	6	191961	191966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529218756
3548	NC_021976	AGG	2	6	191988	191993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	529218756
3549	NC_021976	TCT	2	6	192009	192014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218756
3550	NC_021976	ATG	2	6	192052	192057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218756
3551	NC_021976	TCT	2	6	192060	192065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218756
3552	NC_021976	GCTC	2	8	192094	192101	0 %	25 %	25 %	50 %	529218756
3553	NC_021976	ATTGT	2	10	192186	192195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021976	TCA	2	6	192207	192212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_021976	CCA	2	6	192399	192404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	529218757
3556	NC_021976	CTG	2	6	192411	192416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218757
3557	NC_021976	ATT	2	6	192550	192555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529218757
3558	NC_021976	GGT	2	6	192620	192625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218757
3559	NC_021976	TGAT	2	8	192700	192707	25 %	50 %	25 %	0 %	529218757
3560	NC_021976	CAA	2	6	192721	192726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218757
3561	NC_021976	TGG	2	6	192768	192773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529218757
3562	NC_021976	T	6	6	192774	192779	0 %	100 %	0 %	0 %	529218757
3563	NC_021976	TGAT	2	8	192811	192818	25 %	50 %	25 %	0 %	529218757
3564	NC_021976	TTTC	2	8	192830	192837	0 %	75 %	0 %	25 %	529218757
3565	NC_021976	CCG	2	6	192905	192910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218757
3566	NC_021976	ATG	2	6	192985	192990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218757
3567	NC_021976	CAA	2	6	193001	193006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529218757
3568	NC_021976	ATG	2	6	193066	193071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218757
3569	NC_021976	A	6	6	193089	193094	100 %	0 %	0 %	0 %	529218757
3570	NC_021976	ATTG	2	8	193119	193126	25 %	50 %	25 %	0 %	529218757
3571	NC_021976	GAA	2	6	193143	193148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218757
3572	NC_021976	GAA	2	6	193155	193160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	529218757
3573	NC_021976	AAT	2	6	193240	193245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021976	ATG	2	6	193299	193304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021976	AAT	2	6	193335	193340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218758
3576	NC_021976	AAT	2	6	193361	193366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218758
3577	NC_021976	CTT	2	6	193395	193400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529218758
3578	NC_021976	GCA	2	6	193425	193430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218758
3579	NC_021976	GAT	2	6	193461	193466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218758
3580	NC_021976	GAT	2	6	193484	193489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218758
3581	NC_021976	ATC	2	6	193556	193561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218758
3582	NC_021976	ACG	2	6	193616	193621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218758
3583	NC_021976	ACG	2	6	193637	193642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	529218758
3584	NC_021976	ATA	2	6	193757	193762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529218758
3585	NC_021976	GCT	2	6	193848	193853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	529218758
3586	NC_021976	GGTA	2	8	193922	193929	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021976	TACC	2	8	193967	193974	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_021976	GGTA	2	8	193979	193986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021976	GTT	2	6	194012	194017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021976	TGA	2	6	194218	194223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218759
3591	NC_021976	GAT	2	6	194329	194334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529218759
3592	NC_021976	ATTT	2	8	194375	194382	25 %	75 %	0 %	0 %	529218759
3593	NC_021976	CAT	2	6	194384	194389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	529218759
3594	NC_021976	GCAT	2	8	194472	194479	25 %	25 %	25 %	25 %	529218759
3595	NC_021976	A	6	6	194498	194503	100 %	0 %	0 %	0 %	529218759
3596	NC_021976	CGC	2	6	194569	194574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529218759
3597	NC_021976	AGTGC	2	10	194601	194610	20 %	20 %	40 %	20 %	529218759
3598	NC_021976	T	6	6	194719	194724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.